Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TXNRD1Q16881 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TXNRD1Q16881 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms