Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATP6V1FQ16864 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6V1FQ16864 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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