Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2F4Q16254 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F4Q16254 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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