Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHRNA6Q15825 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHRNA6Q15825 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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