Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCAPHQ15003 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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