Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHD4Q14839 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHD4Q14839 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHD4Q14839 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
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