Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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SKP2Q13309 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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SKP2Q13309 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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SKP2Q13309 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SKP2Q13309 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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