Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SEMA3BQ13214 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEMA3BQ13214 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms