Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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