Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GRIN2AQ12879 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms