Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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GTF3C1Q12789 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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GTF3C1Q12789 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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GTF3C1Q12789 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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GTF3C1Q12789 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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GTF3C1Q12789 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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GTF3C1Q12789 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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GTF3C1Q12789 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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GTF3C1Q12789 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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GTF3C1Q12789 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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GTF3C1Q12789 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GTF3C1Q12789 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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