Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 RPS27BYHR021C 249 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 MRPL33YMR286W 261 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YNR042WYNR042W 429 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YPR014CYPR014C 330 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 POL1YNL102W 4407 nt3.43□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 LOS1YKL205W 3303 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YLL007CYLL007C 1998 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YGL140CYGL140C 3660 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YDR426CYDR426C 378 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YER121WYER121W 345 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YOR376WYOR376W 369 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 USA1YML029W 2517 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 ETP1YHL010C 1758 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 TOF2YKR010C 2316 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 IGO2YHR132W-A 396 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YIL059CYIL059C 366 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YLR416CYLR416C 399 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 GOT1YMR292W 417 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YPR053CYPR053C 456 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 MCD4YKL165C 2760 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 OSH3YHR073W 2991 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 NPR1YNL183C 2373 nt3.4□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 SIP3YNL257C 3690 nt3.4□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 RAD26YJR035W 3258 nt3.4□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 CWH43YCR017C 2862 nt3.4□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 SWI1YPL016W 3945 nt3.4□□□□□ -1.86
TY1A-NL1Q12391 YGR051CYGR051C 324 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 UPS1YLR193C 528 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 YOL075CYOL075C 3885 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 LCD1YDR499W 2244 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 PDE2YOR360C 1581 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 DOA4YDR069C 2781 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 GCD6YDR211W 2139 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 SOD1YJR104C 465 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 RPL38YLR325C 237 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 GYL1YMR192W 2163 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 SEC5YDR166C 2916 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 APC2YLR127C 2562 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 DIS3YOL021C 3006 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 NOG1YPL093W 1944 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 NUP159YIL115C 4383 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 CIN1YOR349W 3045 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 TMA17YDL110C 453 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 YHR032C-AYHR032C-A 120 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 APC9YLR102C 798 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 YMR326CYMR326C 309 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 snR191snR191 274 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 SKT5YBL061C 2091 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 MDM20YOL076W 2391 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 VTC4YJL012C 2166 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 NSP1YJL041W 2472 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 PWP2YCR057C 2772 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 SWA2YDR320C 2007 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 YDR544CYDR544C 429 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 PEX1YKL197C 3132 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 PRP42YDR235W 1635 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 PSF1YDR013W 627 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 SNU13YEL026W 381 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 POG1YIL122W 1056 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 YML007C-AYML007C-A 111 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 RSM19YNR037C 276 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 YPR092WYPR092W 306 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 RPS23BYPR132W 438 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 NUT2YPR168W 474 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 NCL1YBL024W 2055 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 TAF1YGR274C 3201 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 CDC27YBL084C 2277 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 YCG1YDR325W 3108 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 FRT2YAL028W 1587 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 RPS17BYDR447C 411 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 QCR7YDR529C 384 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 YMR324CYMR324C 243 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1A-NL1Q12391 RSC1YGR056W 2787 nt3.34□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 IOC2YLR095C 2439 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 TRS120YDR407C 3870 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 GEP4YHR100C 558 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 YML037CYML037C 1023 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 DAN4YJR151C 3486 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 HFM1YGL251C 3564 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 PEX8YGR077C 1770 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 TFB5YDR079C-A 219 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 SSS1YDR086C 243 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 ARO80YDR421W 2853 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 SNU114YKL173W 3027 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 ERP6YGL002W 651 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 RPL20BYOR312C 519 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 SNC2YOR327C 348 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 XRN1YGL173C 4587 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1A-NL1Q12391 KEL2YGR238C 2649 nt3.31□□□□□ -1.88
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