Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC3A1Q07837 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC3A1Q07837 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms