Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNDQ07001 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNDQ07001 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms