Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms