Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 TAD1YGL243W 1203 nt1.46□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 RAM2YKL019W 951 nt1.46□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 RPC25YKL144C 639 nt1.46□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.46□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 ERG29YMR134W 714 nt1.46□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 GIM3YNL153C 390 nt1.46□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YBR063CYBR063C 1215 nt1.46□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 TAZ1YPR140W 1146 nt1.46□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 NIC96YFR002W 2520 nt1.45□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 NDD1YOR372C 1665 nt1.45□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 RAD6YGL058W 519 nt1.45□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 SEC28YIL076W 891 nt1.45□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YJL119CYJL119C 324 nt1.45□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YOR333CYOR333C 417 nt1.45□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YBR174CYBR174C 315 nt1.45□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 TRS20YBR254C 528 nt1.45□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 PTC5YOR090C 1719 nt1.45□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 snR5snR5 204 nt1.44□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 CDC50YCR094W 1176 nt1.44□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 snR83snR83 306 nt1.44□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YDR537CYDR537C 606 nt1.44□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 SPO11YHL022C 1197 nt1.44□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 ACF4YJR083C 930 nt1.44□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 LSM7YNL147W 348 nt1.44□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YPR170CYPR170C 336 nt1.44□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 ATG11YPR049C 3537 nt1.44□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YOR019WYOR019W 2193 nt1.44□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 BFA1YJR053W 1725 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 TDA9YML081W 3756 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 AHC2YCR082W 387 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 FAR7YFR008W 666 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 NOP10YHR072W-A 177 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 AIM18YHR198C 966 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 SRP21YKL122C 504 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 SDS22YKL193C 1017 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 ATG38YLR211C 681 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YNL050CYNL050C 813 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YCL002CYCL002C 792 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 NAN1YPL126W 2691 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 CHS1YNL192W 3396 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YLR419WYLR419W 4308 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 MET18YIL128W 3099 nt1.43□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 Q0255Q0255 1419 nt1.42□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 IRC2YDR112W 309 nt1.42□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 HOP2YGL033W 657 nt1.42□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 DFG10YIL049W 762 nt1.42□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt1.42□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YJL147CYJL147C 1149 nt1.42□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 TAP42YMR028W 1101 nt1.42□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 SEN15YMR059W 387 nt1.42□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YNL150WYNL150W 408 nt1.42□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 NCL1YBL024W 2055 nt1.42□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 MNE1YOR350C 1992 nt1.41□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 VMR1YHL035C 4779 nt1.41□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 MSH6YDR097C 3729 nt1.41□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YDL009CYDL009C 324 nt1.41□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 RPL40AYIL148W 387 nt1.41□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 IST3YIR005W 447 nt1.41□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 PEP8YJL053W 1140 nt1.41□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YLR053CYLR053C 327 nt1.41□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YLR458WYLR458W 381 nt1.41□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 ATP18YML081C-A 180 nt1.41□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 FYV12YOR183W 390 nt1.41□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 TOA1YOR194C 861 nt1.41□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 RPB5YBR154C 648 nt1.41□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 MGR1YCL044C 1254 nt1.41□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 YLR422WYLR422W 5799 nt1.41□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 LYS9YNR050C 1341 nt1.4□□□□□ -2.18
NEJ1Q06148 PAU3YCR104W 375 nt1.4□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YDR018CYDR018C 1191 nt1.4□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 RPL37BYDR500C 267 nt1.4□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 RPL29YFR032C-A 180 nt1.4□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.4□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YLR031WYLR031W 561 nt1.4□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YNL319WYNL319W 441 nt1.4□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 ATP15YPL271W 189 nt1.4□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 CDC53YDL132W 2448 nt1.4□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 PET127YOR017W 2403 nt1.4□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YDR341CYDR341C 1824 nt1.39□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 MND1YGL183C 660 nt1.39□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 MSL1YIR009W 336 nt1.39□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 SSK2YNR031C 4740 nt1.39□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.39□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 SPC110YDR356W 2835 nt1.39□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 RRI2YOL117W 1938 nt1.38□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YJR039WYJR039W 3366 nt1.38□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 CRD1YDL142C 852 nt1.38□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt1.38□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YMR254CYMR254C 309 nt1.38□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt1.38□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 SXM1YDR395W 2835 nt1.38□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 PIK1YNL267W 3201 nt1.38□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 BRO1YPL084W 2535 nt1.37□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 SPO22YIL073C 2928 nt1.37□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.6 ms