Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KDSRQ06136 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms