Protein–RNA interactions for Protein: Q06070

YLR407W, Uncharacterized protein YLR407W, yeastyeast

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR407WQ06070 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2.99□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 BRO1YPL084W 2535 nt2.99□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 PFK26YIL107C 2484 nt2.99□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 DNA2YHR164C 4569 nt2.99□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 RMT2YDR465C 1239 nt2.98□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt2.98□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt2.98□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 HYR1YIR037W 492 nt2.98□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 LCL2YLR104W 396 nt2.98□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 YJR003CYJR003C 1560 nt2.98□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 YPK1YKL126W 2043 nt2.98□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 BPT1YLL015W 4680 nt2.98□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 SSE1YPL106C 2082 nt2.97□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 BUD4YJR092W 4344 nt2.97□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 YDR250CYDR250C 276 nt2.97□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 VTI1YMR197C 654 nt2.97□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 YPL225WYPL225W 441 nt2.97□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 YPL238CYPL238C 390 nt2.97□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.97□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 SRO77YBL106C 3033 nt2.97□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 DSE4YNR067C 3354 nt2.97□□□□□ -1.93
YLR407WQ06070 URM1YIL008W 300 nt2.96□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 PTP3YER075C 2787 nt2.96□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 TPS2YDR074W 2691 nt2.96□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 BAS1YKR099W 2436 nt2.95□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 NPR3YHL023C 3441 nt2.95□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 DYN2YDR424C 279 nt2.95□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 NCE101YJL205C 162 nt2.95□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 RPS22BYLR367W 393 nt2.95□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 MGR1YCL044C 1254 nt2.95□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 NUP82YJL061W 2142 nt2.95□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 PUF4YGL014W 2667 nt2.95□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 RPO41YFL036W 4056 nt2.94□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 COX1Q0045 1605 nt2.94□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 PSY2YNL201C 2577 nt2.94□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 CDC50YCR094W 1176 nt2.94□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 ABM1YJR108W 372 nt2.94□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 YKL118WYKL118W 312 nt2.94□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 MRPL31YKL138C 396 nt2.94□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 COX7YMR256C 183 nt2.94□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 COQ10YOL008W 624 nt2.94□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 EGD1YPL037C 474 nt2.94□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 PSO2YMR137C 1986 nt2.94□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 YER181CYER181C 324 nt2.93□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.93□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 YIL054WYIL054W 318 nt2.93□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 GPI14YJR013W 1212 nt2.93□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 RPS28BYLR264W 204 nt2.93□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 ATP15YPL271W 189 nt2.93□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 RCY1YJL204C 2523 nt2.93□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 MSS11YMR164C 2277 nt2.93□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 TCP1YDR212W 1680 nt2.92□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 VPS52YDR484W 1926 nt2.92□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 YDR008CYDR008C 351 nt2.92□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.92□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.92□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.92□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.92□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.92□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.92□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 YLR458WYLR458W 381 nt2.92□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 SKT5YBL061C 2091 nt2.92□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 YJL181WYJL181W 1836 nt2.91□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 SPO71YDR104C 3738 nt2.91□□□□□ -1.94
YLR407WQ06070 YDL041WYDL041W 354 nt2.9□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 MAM33YIL070C 801 nt2.9□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 RAM2YKL019W 951 nt2.9□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 YBL108WYBL108W 306 nt2.9□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 TRM7YBR061C 933 nt2.9□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 RGR1YLR071C 3249 nt2.9□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 NET1YJL076W 3570 nt2.89□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 snR76snR76 109 nt2.89□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 AAD16YFL057C 459 nt2.89□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 BIL1YOR304C-A 231 nt2.89□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 RRM3YHR031C 2172 nt2.88□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 RPL40AYIL148W 387 nt2.88□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 CCW14YLR390W-A 717 nt2.88□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 SRB8YCR081W 4284 nt2.88□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 YHL037CYHL037C 402 nt2.87□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 PAU14YIL176C 363 nt2.87□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 PAU1YJL223C 363 nt2.87□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 TMA22YJR014W 597 nt2.87□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 RPS18BYML026C 441 nt2.87□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 RPL9BYNL067W 576 nt2.87□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 YOR055WYOR055W 435 nt2.87□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 FMP23YBR047W 528 nt2.87□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 YBR197CYBR197C 654 nt2.87□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 STT4YLR305C 5703 nt2.87□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 ECM29YHL030W 5607 nt2.87□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 ARP8YOR141C 2646 nt2.86□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.86□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 AYR1YIL124W 894 nt2.86□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 YAR053WYAR053W 297 nt2.86□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.86□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 RGM1YMR182C 636 nt2.86□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 YAF9YNL107W 681 nt2.86□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 RPL25YOL127W 429 nt2.86□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 YOR050CYOR050C 348 nt2.86□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 IRC10YOL015W 1761 nt2.86□□□□□ -1.95
YLR407WQ06070 ROM1YGR070W 3468 nt2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.8 ms