Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNT1Q02742 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms