Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX6P78412 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX6P78412 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX6P78412 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX6P78412 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX6P78412 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX6P78412 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRX6P78412 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX6P78412 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX6P78412 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX6P78412 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX6P78412 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX6P78412 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX6P78412 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX6P78412 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX6P78412 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX6P78412 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX6P78412 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX6P78412 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX6P78412 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX6P78412 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRX6P78412 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX6P78412 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX6P78412 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX6P78412 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX6P78412 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX6P78412 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX6P78412 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX6P78412 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX6P78412 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX6P78412 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX6P78412 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX6P78412 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX6P78412 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX6P78412 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX6P78412 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX6P78412 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
IRX6P78412 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRX6P78412 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX6P78412 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX6P78412 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX6P78412 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX6P78412 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX6P78412 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX6P78412 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX6P78412 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX6P78412 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX6P78412 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX6P78412 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX6P78412 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX6P78412 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX6P78412 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRX6P78412 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
IRX6P78412 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX6P78412 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX6P78412 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX6P78412 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX6P78412 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX6P78412 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX6P78412 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX6P78412 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX6P78412 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX6P78412 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX6P78412 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX6P78412 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX6P78412 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX6P78412 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX6P78412 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRX6P78412 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX6P78412 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX6P78412 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX6P78412 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX6P78412 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRX6P78412 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms