Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HERVK_113P63132 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HERVK_113P63132 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms