Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL30P62888 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL30P62888 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPL30P62888 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPL30P62888 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL30P62888 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL30P62888 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL30P62888 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL30P62888 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL30P62888 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL30P62888 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL30P62888 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL30P62888 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL30P62888 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL30P62888 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL30P62888 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL30P62888 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL30P62888 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL30P62888 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL30P62888 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL30P62888 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL30P62888 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL30P62888 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL30P62888 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL30P62888 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL30P62888 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL30P62888 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL30P62888 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL30P62888 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL30P62888 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL30P62888 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL30P62888 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL30P62888 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL30P62888 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL30P62888 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL30P62888 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL30P62888 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms