Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms