Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNRPFP62306 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRPFP62306 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms