Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP46P62068 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP46P62068 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP46P62068 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP46P62068 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP46P62068 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP46P62068 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP46P62068 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP46P62068 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP46P62068 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP46P62068 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP46P62068 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP46P62068 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP46P62068 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP46P62068 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP46P62068 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP46P62068 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP46P62068 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP46P62068 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP46P62068 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP46P62068 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP46P62068 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP46P62068 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP46P62068 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP46P62068 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP46P62068 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP46P62068 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP46P62068 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP46P62068 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP46P62068 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP46P62068 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP46P62068 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP46P62068 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP46P62068 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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