Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ERVFC1-1P60608 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms