Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ERVPABLB-1P60509 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVPABLB-1P60509 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms