Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL3P58872 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms