Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAG2P55895 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAG2P55895 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAG2P55895 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAG2P55895 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAG2P55895 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAG2P55895 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAG2P55895 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAG2P55895 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAG2P55895 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAG2P55895 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAG2P55895 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAG2P55895 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAG2P55895 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAG2P55895 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAG2P55895 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms