Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRPF1P55201 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms