Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCKAP1LP55160 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCKAP1LP55160 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms