Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB3P54284 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB3P54284 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms