Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATN1P54259 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATN1P54259 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATN1P54259 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATN1P54259 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATN1P54259 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATN1P54259 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATN1P54259 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATN1P54259 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATN1P54259 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATN1P54259 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATN1P54259 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATN1P54259 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATN1P54259 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATN1P54259 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATN1P54259 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATN1P54259 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATN1P54259 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATN1P54259 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATN1P54259 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATN1P54259 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATN1P54259 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATN1P54259 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATN1P54259 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATN1P54259 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATN1P54259 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATN1P54259 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATN1P54259 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATN1P54259 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATN1P54259 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATN1P54259 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATN1P54259 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATN1P54259 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATN1P54259 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATN1P54259 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATN1P54259 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATN1P54259 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATN1P54259 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATN1P54259 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATN1P54259 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATN1P54259 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATN1P54259 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATN1P54259 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATN1P54259 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATN1P54259 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATN1P54259 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATN1P54259 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATN1P54259 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATN1P54259 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATN1P54259 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATN1P54259 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATN1P54259 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATN1P54259 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATN1P54259 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATN1P54259 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATN1P54259 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATN1P54259 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATN1P54259 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATN1P54259 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATN1P54259 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATN1P54259 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATN1P54259 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms