Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
AP3M2P53677 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3M2P53677 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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