Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NDST1P52848 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NDST1P52848 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NDST1P52848 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDST1P52848 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDST1P52848 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDST1P52848 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDST1P52848 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDST1P52848 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDST1P52848 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDST1P52848 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NDST1P52848 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDST1P52848 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDST1P52848 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDST1P52848 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NDST1P52848 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDST1P52848 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDST1P52848 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDST1P52848 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDST1P52848 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDST1P52848 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDST1P52848 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDST1P52848 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NDST1P52848 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NDST1P52848 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NDST1P52848 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDST1P52848 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NDST1P52848 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDST1P52848 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDST1P52848 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDST1P52848 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDST1P52848 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NDST1P52848 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDST1P52848 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDST1P52848 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDST1P52848 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDST1P52848 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDST1P52848 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDST1P52848 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDST1P52848 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDST1P52848 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDST1P52848 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDST1P52848 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDST1P52848 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDST1P52848 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDST1P52848 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDST1P52848 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDST1P52848 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NDST1P52848 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NDST1P52848 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms