Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP11P51784 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP11P51784 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP11P51784 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP11P51784 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP11P51784 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP11P51784 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP11P51784 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP11P51784 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP11P51784 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP11P51784 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP11P51784 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP11P51784 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP11P51784 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP11P51784 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP11P51784 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP11P51784 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP11P51784 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP11P51784 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP11P51784 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP11P51784 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP11P51784 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP11P51784 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP11P51784 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP11P51784 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP11P51784 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP11P51784 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP11P51784 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP11P51784 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP11P51784 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP11P51784 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP11P51784 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP11P51784 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP11P51784 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP11P51784 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP11P51784 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP11P51784 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP11P51784 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP11P51784 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP11P51784 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP11P51784 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP11P51784 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP11P51784 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP11P51784 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP11P51784 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP11P51784 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP11P51784 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP11P51784 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP11P51784 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms