Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB27AP51159 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB27AP51159 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms