Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAMP50895 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAMP50895 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAMP50895 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAMP50895 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCAMP50895 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAMP50895 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAMP50895 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAMP50895 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAMP50895 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAMP50895 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAMP50895 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAMP50895 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAMP50895 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAMP50895 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAMP50895 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAMP50895 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAMP50895 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAMP50895 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAMP50895 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BCAMP50895 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAMP50895 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAMP50895 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAMP50895 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAMP50895 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAMP50895 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAMP50895 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAMP50895 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAMP50895 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAMP50895 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAMP50895 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAMP50895 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BCAMP50895 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAMP50895 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAMP50895 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAMP50895 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAMP50895 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAMP50895 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAMP50895 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAMP50895 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAMP50895 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAMP50895 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAMP50895 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAMP50895 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BCAMP50895 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BCAMP50895 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BCAMP50895 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BCAMP50895 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BCAMP50895 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms