Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPFP49454 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPFP49454 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPFP49454 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPFP49454 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPFP49454 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPFP49454 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPFP49454 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPFP49454 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPFP49454 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPFP49454 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPFP49454 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPFP49454 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPFP49454 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPFP49454 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPFP49454 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPFP49454 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPFP49454 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPFP49454 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPFP49454 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPFP49454 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPFP49454 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPFP49454 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPFP49454 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPFP49454 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPFP49454 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPFP49454 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPFP49454 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CENPFP49454 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPFP49454 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPFP49454 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPFP49454 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPFP49454 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPFP49454 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPFP49454 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPFP49454 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPFP49454 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPFP49454 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPFP49454 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPFP49454 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPFP49454 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPFP49454 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPFP49454 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
CENPFP49454 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPFP49454 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPFP49454 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPFP49454 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPFP49454 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPFP49454 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPFP49454 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPFP49454 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPFP49454 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPFP49454 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPFP49454 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPFP49454 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPFP49454 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPFP49454 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPFP49454 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPFP49454 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPFP49454 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPFP49454 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPFP49454 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPFP49454 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPFP49454 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPFP49454 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPFP49454 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPFP49454 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPFP49454 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPFP49454 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPFP49454 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPFP49454 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPFP49454 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPFP49454 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPFP49454 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPFP49454 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPFP49454 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPFP49454 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPFP49454 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPFP49454 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPFP49454 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPFP49454 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPFP49454 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms