Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTBP49356 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTBP49356 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTBP49356 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTBP49356 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FNTBP49356 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTBP49356 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTBP49356 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTBP49356 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTBP49356 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTBP49356 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTBP49356 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTBP49356 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTBP49356 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTBP49356 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTBP49356 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FNTBP49356 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FNTBP49356 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTBP49356 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTBP49356 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTBP49356 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTBP49356 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTBP49356 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTBP49356 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTBP49356 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTBP49356 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTBP49356 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTBP49356 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTBP49356 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTBP49356 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTBP49356 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTBP49356 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTBP49356 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTBP49356 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FNTBP49356 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FNTBP49356 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTBP49356 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTBP49356 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTBP49356 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTBP49356 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTBP49356 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTBP49356 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTBP49356 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTBP49356 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTBP49356 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTBP49356 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTBP49356 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTBP49356 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTBP49356 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FNTBP49356 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
FNTBP49356 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
FNTBP49356 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTBP49356 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTBP49356 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTBP49356 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTBP49356 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTBP49356 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTBP49356 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTBP49356 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTBP49356 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FNTBP49356 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms