Protein–RNA interactions for Protein: P48048

KCNJ1, ATP-sensitive inward rectifier potassium channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ1P48048 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNJ1P48048 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNJ1P48048 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms