Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTRNP46939 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UTRNP46939 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UTRNP46939 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
UTRNP46939 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UTRNP46939 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UTRNP46939 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UTRNP46939 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
UTRNP46939 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UTRNP46939 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
UTRNP46939 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UTRNP46939 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UTRNP46939 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UTRNP46939 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UTRNP46939 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UTRNP46939 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UTRNP46939 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UTRNP46939 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UTRNP46939 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UTRNP46939 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UTRNP46939 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UTRNP46939 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UTRNP46939 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UTRNP46939 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UTRNP46939 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UTRNP46939 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UTRNP46939 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UTRNP46939 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UTRNP46939 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UTRNP46939 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UTRNP46939 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UTRNP46939 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UTRNP46939 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UTRNP46939 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UTRNP46939 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UTRNP46939 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UTRNP46939 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UTRNP46939 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UTRNP46939 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UTRNP46939 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UTRNP46939 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UTRNP46939 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UTRNP46939 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UTRNP46939 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UTRNP46939 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UTRNP46939 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UTRNP46939 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UTRNP46939 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UTRNP46939 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UTRNP46939 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UTRNP46939 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UTRNP46939 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UTRNP46939 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UTRNP46939 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UTRNP46939 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UTRNP46939 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UTRNP46939 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UTRNP46939 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UTRNP46939 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UTRNP46939 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UTRNP46939 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTRNP46939 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTRNP46939 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTRNP46939 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTRNP46939 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTRNP46939 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTRNP46939 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTRNP46939 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTRNP46939 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTRNP46939 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UTRNP46939 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UTRNP46939 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTRNP46939 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTRNP46939 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTRNP46939 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UTRNP46939 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTRNP46939 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTRNP46939 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTRNP46939 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTRNP46939 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTRNP46939 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTRNP46939 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UTRNP46939 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms