Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GGCXP38435 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGCXP38435 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGCXP38435 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGCXP38435 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGCXP38435 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGCXP38435 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGCXP38435 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGCXP38435 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GGCXP38435 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGCXP38435 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGCXP38435 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGCXP38435 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGCXP38435 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGCXP38435 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGCXP38435 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGCXP38435 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGCXP38435 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GGCXP38435 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GGCXP38435 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GGCXP38435 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GGCXP38435 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GGCXP38435 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms