Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LTBRP36941 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LTBRP36941 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LTBRP36941 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LTBRP36941 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LTBRP36941 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBRP36941 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LTBRP36941 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBRP36941 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBRP36941 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBRP36941 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBRP36941 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBRP36941 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBRP36941 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBRP36941 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBRP36941 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBRP36941 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBRP36941 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBRP36941 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LTBRP36941 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LTBRP36941 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LTBRP36941 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTBRP36941 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTBRP36941 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LTBRP36941 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LTBRP36941 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LTBRP36941 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LTBRP36941 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LTBRP36941 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LTBRP36941 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LTBRP36941 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LTBRP36941 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTBRP36941 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTBRP36941 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTBRP36941 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LTBRP36941 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBRP36941 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBRP36941 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBRP36941 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBRP36941 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBRP36941 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBRP36941 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBRP36941 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBRP36941 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBRP36941 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBRP36941 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LTBRP36941 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LTBRP36941 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LTBRP36941 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LTBRP36941 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms