Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NF2P35240 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NF2P35240 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NF2P35240 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NF2P35240 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NF2P35240 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NF2P35240 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NF2P35240 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NF2P35240 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NF2P35240 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NF2P35240 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NF2P35240 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NF2P35240 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NF2P35240 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NF2P35240 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NF2P35240 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NF2P35240 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NF2P35240 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NF2P35240 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NF2P35240 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NF2P35240 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NF2P35240 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NF2P35240 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NF2P35240 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NF2P35240 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NF2P35240 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NF2P35240 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NF2P35240 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NF2P35240 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NF2P35240 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NF2P35240 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NF2P35240 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NF2P35240 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NF2P35240 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NF2P35240 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NF2P35240 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NF2P35240 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NF2P35240 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NF2P35240 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NF2P35240 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NF2P35240 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NF2P35240 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NF2P35240 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NF2P35240 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NF2P35240 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NF2P35240 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NF2P35240 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NF2P35240 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NF2P35240 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NF2P35240 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NF2P35240 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NF2P35240 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NF2P35240 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NF2P35240 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NF2P35240 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NF2P35240 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NF2P35240 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NF2P35240 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NF2P35240 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NF2P35240 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NF2P35240 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NF2P35240 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NF2P35240 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NF2P35240 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NF2P35240 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NF2P35240 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NF2P35240 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NF2P35240 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms