Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF4P34130 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF4P34130 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF4P34130 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF4P34130 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF4P34130 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF4P34130 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF4P34130 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF4P34130 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF4P34130 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF4P34130 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF4P34130 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF4P34130 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF4P34130 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF4P34130 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NTF4P34130 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NTF4P34130 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NTF4P34130 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NTF4P34130 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NTF4P34130 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF4P34130 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF4P34130 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF4P34130 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF4P34130 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF4P34130 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF4P34130 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NTF4P34130 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms