Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 SAK1YER129W 3429 nt2.81□□□□□ -1.96
NIC96P34077 MDM1YML104C 3384 nt2.8□□□□□ -1.96
NIC96P34077 YIL080WYIL080W 4722 nt2.8□□□□□ -1.96
NIC96P34077 ACB1YGR037C 264 nt2.8□□□□□ -1.96
NIC96P34077 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.8□□□□□ -1.96
NIC96P34077 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.8□□□□□ -1.96
NIC96P34077 YPL185WYPL185W 396 nt2.8□□□□□ -1.96
NIC96P34077 RAX2YLR084C 3663 nt2.8□□□□□ -1.96
NIC96P34077 SNU114YKL173W 3027 nt2.8□□□□□ -1.96
NIC96P34077 SEC7YDR170C 6030 nt2.8□□□□□ -1.96
NIC96P34077 CDC20YGL116W 1833 nt2.79□□□□□ -1.96
NIC96P34077 VPS16YPL045W 2397 nt2.79□□□□□ -1.96
NIC96P34077 HOS4YIL112W 3252 nt2.79□□□□□ -1.96
NIC96P34077 YFR056CYFR056C 369 nt2.79□□□□□ -1.96
NIC96P34077 YOR385WYOR385W 873 nt2.79□□□□□ -1.96
NIC96P34077 PTC5YOR090C 1719 nt2.79□□□□□ -1.96
NIC96P34077 FLO11YIR019C 4104 nt2.78□□□□□ -1.96
NIC96P34077 SDC1YDR469W 528 nt2.78□□□□□ -1.96
NIC96P34077 YGR025WYGR025W 303 nt2.78□□□□□ -1.96
NIC96P34077 RTT102YGR275W 474 nt2.78□□□□□ -1.96
NIC96P34077 YLR434CYLR434C 384 nt2.78□□□□□ -1.96
NIC96P34077 snR42snR42 351 nt2.78□□□□□ -1.96
NIC96P34077 POL3YDL102W 3294 nt2.78□□□□□ -1.96
NIC96P34077 UBP11YKR098C 2154 nt2.78□□□□□ -1.96
NIC96P34077 PRK1YIL095W 2433 nt2.78□□□□□ -1.97
NIC96P34077 MMS1YPR164W 4224 nt2.77□□□□□ -1.97
NIC96P34077 HSC82YMR186W 2118 nt2.77□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.77□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.77□□□□□ -1.97
NIC96P34077 ROX1YPR065W 1107 nt2.77□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YPR203WYPR203W 309 nt2.77□□□□□ -1.97
NIC96P34077 PFF1YBR074W 2931 nt2.77□□□□□ -1.97
NIC96P34077 NCL1YBL024W 2055 nt2.77□□□□□ -1.97
NIC96P34077 SDH7YDR511W 402 nt2.76□□□□□ -1.97
NIC96P34077 UBC7YMR022W 498 nt2.76□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.76□□□□□ -1.97
NIC96P34077 REV1YOR346W 2958 nt2.76□□□□□ -1.97
NIC96P34077 TOP2YNL088W 4287 nt2.76□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YOR296WYOR296W 3870 nt2.76□□□□□ -1.97
NIC96P34077 NIC96YFR002W 2520 nt2.76□□□□□ -1.97
NIC96P34077 MSL5YLR116W 1431 nt2.76□□□□□ -1.97
NIC96P34077 ILS1YBL076C 3219 nt2.76□□□□□ -1.97
NIC96P34077 MRD1YPR112C 2664 nt2.75□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YEL043WYEL043W 2871 nt2.75□□□□□ -1.97
NIC96P34077 SAP1YER047C 2694 nt2.75□□□□□ -1.97
NIC96P34077 FMP16YDR070C 282 nt2.75□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YDR193WYDR193W 399 nt2.75□□□□□ -1.97
NIC96P34077 RPS29AYLR388W 171 nt2.75□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YNL010WYNL010W 726 nt2.75□□□□□ -1.97
NIC96P34077 LSM7YNL147W 348 nt2.75□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YSY6YBR162W-A 198 nt2.75□□□□□ -1.97
NIC96P34077 CBF2YGR140W 2871 nt2.75□□□□□ -1.97
NIC96P34077 VPS52YDR484W 1926 nt2.75□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YNL018CYNL018C 1839 nt2.75□□□□□ -1.97
NIC96P34077 NAN1YPL126W 2691 nt2.75□□□□□ -1.97
NIC96P34077 MPH1YIR002C 2982 nt2.74□□□□□ -1.97
NIC96P34077 ISW1YBR245C 3390 nt2.74□□□□□ -1.97
NIC96P34077 FAR11YNL127W 2862 nt2.74□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.74□□□□□ -1.97
NIC96P34077 MZM1YDR493W 372 nt2.74□□□□□ -1.97
NIC96P34077 AYR1YIL124W 894 nt2.74□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YLR031WYLR031W 561 nt2.74□□□□□ -1.97
NIC96P34077 ERP4YOR016C 624 nt2.74□□□□□ -1.97
NIC96P34077 ATP3YBR039W 936 nt2.74□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.74□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YGR067CYGR067C 2415 nt2.74□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YSW1YBR148W 1830 nt2.74□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YJL070CYJL070C 2667 nt2.74□□□□□ -1.97
NIC96P34077 SMY2YBR172C 2223 nt2.73□□□□□ -1.97
NIC96P34077 JSN1YJR091C 3276 nt2.73□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YJR098CYJR098C 1971 nt2.73□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YDL041WYDL041W 354 nt2.73□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.73□□□□□ -1.97
NIC96P34077 VOA1YGR106C 798 nt2.73□□□□□ -1.97
NIC96P34077 RPS24BYIL069C 408 nt2.73□□□□□ -1.97
NIC96P34077 SHE2YKL130C 741 nt2.73□□□□□ -1.97
NIC96P34077 RPL40BYKR094C 387 nt2.73□□□□□ -1.97
NIC96P34077 ZEO1YOL109W 342 nt2.73□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.73□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YBR277CYBR277C 402 nt2.73□□□□□ -1.97
NIC96P34077 IPT1YDR072C 1584 nt2.73□□□□□ -1.97
NIC96P34077 SWA2YDR320C 2007 nt2.73□□□□□ -1.97
NIC96P34077 TLC1TLC1 1301 nt2.72□□□□□ -1.97
NIC96P34077 GIS1YDR096W 2685 nt2.72□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YHL005CYHL005C 393 nt2.72□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.72□□□□□ -1.97
NIC96P34077 COX7YMR256C 183 nt2.72□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YOR199WYOR199W 330 nt2.72□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YPL225WYPL225W 441 nt2.72□□□□□ -1.97
NIC96P34077 TRS130YMR218C 3309 nt2.72□□□□□ -1.97
NIC96P34077 RGC1YPR115W 3252 nt2.72□□□□□ -1.97
NIC96P34077 MMS22YLR320W 4365 nt2.72□□□□□ -1.97
NIC96P34077 YDR186CYDR186C 2634 nt2.71□□□□□ -1.98
NIC96P34077 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.71□□□□□ -1.98
NIC96P34077 PET191YJR034W 327 nt2.71□□□□□ -1.98
NIC96P34077 SNX41YDR425W 1878 nt2.71□□□□□ -1.98
NIC96P34077 BPT1YLL015W 4680 nt2.71□□□□□ -1.98
NIC96P34077 IRC10YOL015W 1761 nt2.7□□□□□ -1.98
NIC96P34077 YDR008CYDR008C 351 nt2.7□□□□□ -1.98
NIC96P34077 GRX8YLR364W 330 nt2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.1 ms