Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NMBRP28336 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMBRP28336 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMBRP28336 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMBRP28336 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMBRP28336 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMBRP28336 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMBRP28336 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMBRP28336 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMBRP28336 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMBRP28336 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMBRP28336 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMBRP28336 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMBRP28336 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMBRP28336 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMBRP28336 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NMBRP28336 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms