Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2B1P20020 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2B1P20020 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms