Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NELFEP18615 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NELFEP18615 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NELFEP18615 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NELFEP18615 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NELFEP18615 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NELFEP18615 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NELFEP18615 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NELFEP18615 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NELFEP18615 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NELFEP18615 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NELFEP18615 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NELFEP18615 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NELFEP18615 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NELFEP18615 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NELFEP18615 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NELFEP18615 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NELFEP18615 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NELFEP18615 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NELFEP18615 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NELFEP18615 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NELFEP18615 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NELFEP18615 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NELFEP18615 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NELFEP18615 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NELFEP18615 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NELFEP18615 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NELFEP18615 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NELFEP18615 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NELFEP18615 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NELFEP18615 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NELFEP18615 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NELFEP18615 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NELFEP18615 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NELFEP18615 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NELFEP18615 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NELFEP18615 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NELFEP18615 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NELFEP18615 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NELFEP18615 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NELFEP18615 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NELFEP18615 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NELFEP18615 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NELFEP18615 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NELFEP18615 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NELFEP18615 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NELFEP18615 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NELFEP18615 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NELFEP18615 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NELFEP18615 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NELFEP18615 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NELFEP18615 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NELFEP18615 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NELFEP18615 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NELFEP18615 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NELFEP18615 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms